植物代谢组学
开发面向大规模 LC-MS 数据的分析方法,探索代谢物注释、来源推断与功能模块。
开发面向大规模 LC-MS 数据的分析方法,探索代谢物注释、来源推断与功能模块。
整合代谢组、转录组与遗传变异,研究植物次生代谢及作物品质性状形成机制。
使用 R、Shiny 与工作流系统,将生物信息分析方法转化为易于使用、可复用的科研工具。
Wang, X., Liu, Y., Jiang, C., Huang, Z., Yan, H., Wong, S. H., Johnson, C. H., Zhang, J., Ge, Y., Zhang, F., Zhang, J., Lai, R., Gao, P., Zhang, X., & Shen, X.
Nature Communications, 17(1), 1755 第一作者
Wang, X., Liang, S., Yang, W., Yu, K., Liang, F., Zhao, B., Zhu, X., Zhou, C., Mur, L. A. J., Roberts, J. A., Zhang, J., & Zhang, X.
Journal of Integrative Plant Biology, 66(11), 2329-2345 第一作者
Chang, Y., Shi, M., Wang, X., Cheng, H., Zhang, J., Liu, H., Wu, H., Ou, X., Yu, K., Zhang, X., Day, B., Miao, C., Zhao, Y., & Jiang, K.
The Plant Cell, 37(4), koaf064 共同第一作者
植物代谢组学数据分析流程
R / SHINY↗参与 tidyMass 团队,主导 Shiny 应用开发
R / NETWORK ANALYSIS↗交互式加权共表达网络分析
GO / ACADEMIC WEBSITES↗学术主页与实验室网站编辑器,支持可视化编辑、Markdown 博客与实时预览。
RUST / NETWORK ANALYSIS↗基于纯 Rust 的加权基因共表达网络分析内核,支持多线程计算,无需配置系统 BLAS。
GO / VUE / RUST↗基于 rsWGCNA 的可视化分析平台,支持一键或分步分析、交互图表与论文级图表导出。
欢迎围绕植物代谢、多组学与科研软件交流。